Cette riche collection est composée de neuf fonds de manuscrits à savoir :

• le fonds Vieillard ;
  le fonds Gaden ;
  le fonds Brévié ;
  le fonds
  le fonds Figaret ;
  le fonds Cheikh Moussa Kamara ;
  le fonds Cremer ;
  le fonds Vincent Monteil ;
  le fonds Amar Samb
  et le fonds des régions.
  Ecrits en arabe et en ajami (peule, wolof, hausa, mandingue, ...), ces manuscrits sont à caractère historique, linguistique, littéraire, religieux et scientifique. Ils comportent également des notes et d'autres archives rédigées en français et des passages en langues africaines transcris en caractères latins. Ils couvrent le Sénégal et les pays de la sous-région ouest africaine.